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libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.9‘ not found

news 来源：原创 2024/11/16 10:30:42

今天遇到一个巨大无比的坑。。。

我怀疑是“pip install XXpackage”常见大坑。

因为在很早之前，我用pip install安装一个小众的github来源包后，安装完，报错如下：

libgcc_s.so.1: version `GCC_4.8.0' not found

那把我折腾的，，，我就真以为要把gcc版本降低成4.8.0才能用，你知道，conda、yum GCC最低版本都要4.8.2了

我真的是从ftp 下载的4.8.0，一顿make & make install，结果还报错了。。。

睡了一觉，我转头一想，不对，是不是liggcc_s.so.1有问题？

于是，我就把之前Seurat环境底下的liggcc_s.so.1拷过去替换了，反正一副死马当成活马医的架势。。。竟然，好了。

之后呢，也就没放心上。

这次，我就用pip install scanpy

安装一切顺利，心中暗喜，以为我人品爆发了，结果，import 果然就出来了幺蛾子

报错同题：

ImportError: /MATLAB/MATLAB_Runtime/v901/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.9' not found

这一个报错，，，一下子就引起了我的警觉，不会是他pip install给我把库搞废了？

我就接着把所有环境下对应宝找了一遍，给他替换上

#系统里所有的同名库都检索一遍
find / -name 'libgcc_s.so.1'
cd /MATLAB/MATLAB_Runtime/v901/sys/os/glnxa64/
## 这儿我纯粹是为了备份，万一拷过去不对还能还原
sudo mv libstdc++.so.6 libstdc++.so.6_20221223
##最后我选择之前在cistarget环境下的一个库拷过去
sudo cp /home/miniconda3/envs/create_cistarget_databases/lib/libstdc++.so.6 .

结果果然就解决了。

推测，就是pip把lib库给更新了，导致莫名其妙的Error缺库，换个新的可能就能解决